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美國科學(xué)家設(shè)計出機(jī)器學(xué)習(xí)算法 輕松生成蛋白質(zhì)的五維圖像
2022-11-04 08:17:37 來源:科技日報 編輯:bj06

美國華盛頓大學(xué)科學(xué)家設(shè)計出一種機(jī)器學(xué)習(xí)算法Deep-SMOLM,生成了蛋白質(zhì)的五維(5D)圖像,包括單個分子的方向和位置等信息。相關(guān)研究發(fā)表于期出版的《光學(xué)快報》雜志,有助于科學(xué)家更好地理解微小尺度下的生物學(xué)過程。

研究人員表示,這里的5D指的并非新的或隱藏的空間維度。他們設(shè)計出的新系統(tǒng)可分辨分子在三維空間中的方向以及在二維空間中的位置,也就是從一張有“噪音”的像素化圖像中提取出5個參數(shù)。為從看似簡單的光點中獲取這些額外的復(fù)雜信息,團(tuán)隊設(shè)計出了機(jī)器學(xué)習(xí)算法Deep-SMOLM,而且增加了額外的步驟。

研究團(tuán)隊稱,在實驗室進(jìn)行的單分子成像往往非常“嘈雜”,包含“斑點”或波動,可能會導(dǎo)致圖像變得模糊不清。對于大多數(shù)機(jī)器學(xué)習(xí)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)來說,有效地處理這種“噪音”可能非常復(fù)雜。鑒于此,研究團(tuán)隊借助Deep-SMOLM處理圖像,還增加了一種“處理后”步驟,能直接計算第一個算法得到的結(jié)果。

在處理了數(shù)千張快照后,研究團(tuán)隊得到了一幅“美麗的圖像”,它使用顏色、曲率和方向來昭示數(shù)千個分子是如何相互連接的。研究人員表示,這一系統(tǒng)將有助于更好地理解微小尺度的生物學(xué)過程,比如淀粉樣蛋白如何聚集形成與阿爾茨海默病相關(guān)的纏結(jié)結(jié)構(gòu)等。

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